현미경과 페트리 접시 외에도 컴퓨터는 미생물 학자에게 중요한 도구입니다. 미생물 연구용 소프트웨어에는 다른 과학 및 공학 분야에서 사용하는 도구와 박테리아 및 기타 미생물 연구를위한 특수 응용 프로그램이 포함됩니다. 정부 기관, 비영리 재단 또는 학술 연구원이 개발 한 많은 응용 프로그램을 무료 소프트웨어로 다운로드하여 실험 또는 실험실에 필요한대로 사용할 수 있습니다.
시각화 도구
수집 한 원시 데이터의 신체적 또는 정신적 그림은 품질, 중요성 및 의미를 더 잘 파악하는 데 도움이 될 수 있습니다. 오픈 소스 및 상용 데이터 시각화 소프트웨어는 미생물 연구에 널리 사용됩니다. LibreOffice Calc, Microsoft의 Excel 또는 Mondrian 데이터 시각화 시스템을 사용하여 데이터 차트와 그래프를 만듭니다. Cell-O 및 RasMol 애플리케이션은 단백질 및 아미노산과 같은 생물학적으로 중요한 분자의 2D 및 3D 애니메이션 모델을 만드는 데 도움이됩니다.
수학적 모델링
대규모의 미생물 데이터 수집은 수치 분석을 마치면 더 의미있는 정보를 제공하는 경우가 많습니다. 과학자 데이터의 수학적 정제, 분석 및 모델링을 수행하는 MATLAB, Octave 및 SciPy 소프트웨어 패키지. 이 패키지를 사용하여 곡선 피팅, 역학 예측, 박테리아 성장 시뮬레이션 및 데이터 노이즈 또는 확률 적 효과 제거를 통해 매개 변수 추정을 수행합니다. 이러한 응용 프로그램은 분산 분석 또는 카이-제곱 테스트와 같은 통계 계산도 수행합니다.
게놈 생물 정보학
미생물학 소프트웨어 애플리케이션은 또한 미생물의 DNA를 구성하는 핵산 서열에서 정보를 시각화하고 채굴하는 데 도움이됩니다. Open Bioinformatics Foundation은 유전체 정보 은행에서 데이터를 추출하고 유기체의 DNA 코드를 구문 분석하고 다른 DNA 샘플과 비교하는 BioJava 및 Biopython과 같은 무료 오픈 소스 DNA 시퀀싱 및 분석 애플리케이션을 제공합니다. 추가 게놈 분석 패키지에는 Emboss, HMMER, Clustal Omega, Phylogeny Inference Package 또는 PHYLIP, Sequence Manipulation Suite 또는 SMS가 포함됩니다.
참조 소프트웨어
미생물학에 대한 과학적 발견의 빠른 속도와 변화하는 정부 규정으로 인해 미생물학자는 자신의 작업에 영향을 미치는 정보에 즉시 액세스 할 수 있어야합니다. HUGO는 미생물 학자에게 도구, 화학 물질, 장비, 배양 배지, 안전 요구 사항, 새로운 유기체, 분류 학적 변경 및 항생제에 대한 최신 정보를 제공하는 상용 소프트웨어 패키지입니다. 또한 식품 과학 분야에서 일하는 미생물학자는 ComBase 브라우저 웹 애플리케이션을 사용하여 영국, 호주 및 미국의 정부 기관에서 제공하는 식품 관련 미생물 데이터에 액세스 할 수 있습니다.
